晕厥是指短暂的意识丧失，可以自动恢复的。肥厚型心肌病的患者可以出现黑蒙晕厥和猝死是一种常见的表现，也是一种病情严重的表现。15%～25%的肥厚型心肌病患者至少发生过一次晕厥，约五分之一的患者主诉黑蒙或短瞬间头晕。左心室舒张末容量降低，左心腔小，不可逆性梗阻和肥厚或非持续性室性心动过速等原因均可能与晕厥发生有关。
最常见的晕厥原因是肥厚型心肌病患者伴有的严重心律失常，包括快速型心律失常和缓慢型心律失常；其次是左心室流出道的梗阻；第三、自主神经功能异常导致的迷走性晕厥。